Xcodeでは新規作成するファイルのヘッダにcopyright表記を入れてくれますが、Xcode4からアドレス帳の会社名を引っ張ってくるようになって請負案件のとき面倒だなーと思っていたところ、プロジェクトごとに設定する方法がありました。
設定方法は以下の通り。
1.Project Navigatorを開き(Cmd+1)、左上のプロジェクト名部分を選択
2.メニューの[View]-[Utilities]-[Show File Inspector](Cmd+Opt+1)でInspectorを開く
3.Project Document下の"Organization"に組織名を設定
設定内容は、PROJECTNAME.xcodeproj/project.pbxprojに保存されます。
ネタ元: How can I change the copyright template in Xcode 4? - Stack Overflow